代理記賬費用收取各異。當前對于小規模納稅人和一般納稅人來說，它們在代理記賬費用收取方面也有不同的標準。根據市場行情來看，小規模納稅人代理記賬費用一般多為200-300元/月，個別情況可達400元/月。而一般納稅人的代理記賬費用多在400-500元/月，特殊情況下可達600-800元/月。因此，萊州注冊公司提醒一般納稅人代理記賬費用普遍高于小規模納稅人。
記賬報稅標準、次數不一。一般納稅人的賬務處理比小規模納稅人高，代理記賬的區別也比較大，無論是從記賬單據、科目設置、稅金核算哪方面來說，較小規模納稅人都更為規范。并且，一般納稅人都是按月申報納稅的，而小規模納稅人則可以選擇按季度申報。所以，在記賬報稅方面，二者也存在明顯差別。
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